蓮如結びと呼ばれる独特の形になります。荘厳念珠や布教用念珠と呼ばれる
簡略化した紐房の念珠も、この独特の蓮如結びを施されます。

蝶々が羽を開いた様に見えるこの結びが、浄土真宗の念珠を特徴付けます。

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日蓮宗の念珠は、天台型を基本として大きく手が加えられます。天台型の表の房（二十一個の房玉の入った方）はそのままで、反対側の房に真言型の様に十個の房玉が入り、加えて数取りという房玉十個の入った房を一本付け足すのです。

この宗派の特徴として、お題目を唱えたりする時など、念珠を擦り合わせて音を立てます。また一般在家の方も必ず略式ではなく正式の日蓮宗の念珠を用います。